用人单位每年用不同公司与员工签劳动合同，出现纠纷时应追究哪家？

根据《劳动合同法》第十四条的规定，如果用人单位和劳动者连续订立二次固定期限劳动合同，期间内劳动者没有违反国家法律或者用人单位的劳动纪律等情形，用人单位应和劳动者签订无固定期限劳动合同。

如果用人单位不签订，而是用不同的子公司来签订，其行为是违法的。

同属一家母公司，因此，你无须考虑合同，现在用人单位副你辞职，你要求半年双倍工资赔偿和其它的补偿即可。